Potravinové predispozície v jednom prehľade
Nahrajte genotypový súbor raz. AlergenRisk vytvorí grafické zhrnutie všetkých panelov a každý výsledok sprístupní v samostatnom detailnom okne.
Genetická predispozícia k alergii na vajce
Nahrajte export SNP čipu. Aplikácia bez internetového prenosu rozpozná 23andMe, MyHeritage alebo DNAEra a pre každý zo štyroch cieľových markerov použije priamy nález alebo najkvalitnejší dostupný proxy SNP.
Nahrať genotypový súbor
Spracovanie prebieha lokálne. Dáta sa neposielajú na server.
Formát a dostupný čipový profil určíme automaticky. Podporované sú 23andMe TXT/TSV, MyHeritage CSV (MHv1.0) a DNAEra CSV (Illumina GSGT). Výpočet nepoužíva sieťové API.
Tento profil bude možné previesť do podporovaného formátu v samostatnom normalizačnom nástroji.
Výsledok sa zobrazí tu
Priamy nález má prednosť. Overené proxy náhrady sa používajú iba tam, kde sú dostupné. Pri paneloch bez overenej spoločnej referencie sa chýbajúce genotypy nedopĺňajú populačným odhadom.
Istota individuálneho zaradenia
v rámci modeluPercento vyjadruje pravdepodobnosť, že skutočné skóre patrí do zobrazovaného pásma po zohľadnení chýbajúcich a imputovaných genotypov. Nevyjadruje klinickú presnosť modelu.
Referenčná distribúcia EUR populácie
všetky kombinácie 4 SNP · skóre 0–8Mapa lokusov a proxy podľa DNA čipu Po nahratí exportu sa príslušný stĺpec doplní skutočne zistenými markermi.
Verzia čipu sa môže v rámci jednej značky líšiť. Preto tabuľka oddeľuje pevnú mapu cieľových lokusov a proxy náhrad od dostupnosti, ktorú aplikácia overí priamo v nahratom súbore.
| Panel | Cieľový lokus | Proxy náhrady v poradí použitia | DNAEra | MyHeritage | 23andMe |
|---|
Pravidlo: priamy cieľový SNP má prednosť. Ak chýba, aplikácia skúša proxy zľava doprava podľa EUR r². Výnimkou je panel Mlieko, kde sa pre tri ciele zámerne používajú rs115288876, rs63582760/rs10588133 a rs17388568.
Vaše genetické predispozície
Potravinové alergény a súvisiace predispozície
Upozornenie: farba vyjadruje iba kategóriu konkrétneho genetického modelu. Nejde o diagnózu, pravdepodobnosť reakcie ani odporúčanie potravinu zaradiť alebo vyradiť.
Význam výsledku
Pôvodné SNP z literatúry
Štyri priame markery a ich účinky pochádzajú z GWAS alergie na potraviny potvrdenej orálnym expozičným testom. Hodnoty pre alergiu na slepačie vajce sú prevzaté z tabuľky 2 pôvodnej štúdie; β je prirodzený logaritmus OR rizikovej alely.
| Marker | Lokus | Efektová alela v štúdii | OR pre vajce | P | Riziková alela modelu | β |
|---|---|---|---|---|---|---|
rs12123821 | FLG-AS1 / FLG | T | 2,74 | 5,4 × 10−12 | T | 1,008 |
rs11949166 | IL4 / KIF3A | T | 0,62 | 2,2 × 10−12 | A | 0,478 |
rs2212434 | C11orf30 / LRRC32 | T | 1,39 | 8,8 × 10−6 | T | 0,329 |
rs1243064 | SERPINB7 / SERPINB2 | A | 1,47 | 4,2 × 10−8 | A | 0,385 |
Identifikované a imputované markery
| Marker | Riziková alela | Genotyp | Pravdepodobnosť | Skóre | β | Spôsob určenia | Použitý proxy SNP | Genotyp proxy | EUR r² |
|---|
Ako čítať proxy stĺpce: program skúša proxy markery v poradí podľa EUR r² a použije prvý prítomný v súbore. Ak chýba cieľ aj všetky jeho náhrady, zobrazí sa „EUR frekvencie (bez proxy)“.
Populačná imputácia nie je individuálne určený genotyp. Spoľahlivosť interpretácie zachytáva iba neistotu spôsobenú chýbajúcimi genotypmi a proxy markerom; nehodnotí klinickú validitu ani pravdepodobnosť alergickej reakcie.